1月25日,一名男子在柬埔寨度假与家人去他们酒店的游泳池游泳。擦干身体后,他尖刺发烧,被送往当地医院,在那里他的鼻子和喉咙都被擦拭和样品进行了测试在他的中国武汉的家乡致命病毒方兴未艾。通过以下下午,诊断交付:柬埔寨的covid-19的第一例。

官员护送样品关科学家在金边作进一步的分析。医院的测试提供了简单的确认: 该病毒是在这里。但了解它的路径和遏制其传播,健康专家需要的细节。如何有病毒来了吗?是它一样的应变在中国攻坚?或者说是相关但不同的病毒已经出现独立?

几个月前,有人曾听到covid-19前,金边实验室已经采用了全新的系统开始,从位于旧金山的研究人员介绍 陈扎克伯格biohub,回答这些问题非常。它实质上由商业基因测序仪和先进的基于云的软件叫 idseq,其识别从它的遗传序列病毒或其他病原体。柬埔寨组中使用该技术来研究疾病,如登革热和疟疾的11级国际传染病的实验室之一。但在一月下旬,柬埔寨科学家把注意力转向 测序新的冠状病毒 新降落在他们的门。

测序数据证实了所怀疑大家:病毒确实曾起源于武汉爆发初期,已经拴在不知情的游客乘坐。更深刻的是,虽然与柬埔寨实验室执行的分析速度和成功大白于biohub队的idseq科技的力量。这里是一个工具,可以精细地追踪 - 从而协助打击 - 什么迅速成为一个全球性流行病。

“在这一点上,我认为这就是我们的优先事项将是 - 把我们的目光投向世界其他地区,以试图遏制火灾那里,说:”生物化学 乔derisi博士,PK10注册网站的汤姆金斯教授和biohub的联席总裁。

“然后火灾来到这里。”


时间表的传说:
国家或全球事件
UCSF事件

 

19年12月31日:
肺炎“原因不明”在武汉被确定,中国

20年1月12日:
中国股市的新型冠状病毒与世界的基因序列

1/26:
加利福尼亚证实covid-19的它的第一情况下,在美国第三

1/30:
科学家在柬埔寨使用biohub的idseq技术跟踪新兴爆发

1/30:
该病毒传播到中国以外的18个国家;谁声明了一个全球卫生紧急情况

1/31:
美国。政府问题的政策,从内部发展劝阻临床实验室covid测试,最终导致广泛的测试延迟和短缺

2/6:
美国。 CDC开始发行自己的测试套件,国有医疗实验室;该试剂盒后发现有缺陷


Joe Derisi wearing a black face mask, white lab coat, and blue gloves in the lab; lab team members work behind him.

PK10注册网站生物化学乔derisi,博士,帮助确定在陈女士扎克伯格biohub 2003现在联席总裁原来的SARS病毒,他带领负责研究中心的一部分转化为covid测试。

由二月下旬,海湾地区已经开始准备迎接它自己的covid案件激增。 derisi与陈慧娴的每天发短信,MD '12,酝酿解决真正的问题。陈在PK10注册网站她的学生日子遇到了derisi,并已通过他的诀窍铲除神秘感染的原因,留下了深刻印象 - 包括2003年的非典疫情和鞭打追杀大蟒蛇,玄凤鹦鹉,和蜜蜂。所以,在2016年,当陈和她的丈夫,Facebook的创始人马克·扎克伯格,做出了 6亿$的礼品创建biohub与根除传染病的目标,他们要求derisi领导它。现在他们想知道他们如何帮助阻止新兴covid流行。

derisi组装小型工作组,以集思广益。那么,出了蓝色,他的手机响了起来。 “我几乎没有回答,因为我认为这是一个推销员,”他回忆道。它实际上是纽森,加州州长。他想知道derisi认为国家应该做些什么来避免其covid响应错误。更多的测试,derisi说,没有丢失一个节拍。如果你想约的人隔离或封锁住了经济的部分明智的决定,他告诉纽瑟姆,你需要知道病毒是和谁的感染。换句话说,你需要能够测试的人很多。 “否则你盲目飞行,”他告诉州长。

交谈了derisi思考。谁是要做到这一切的测试?这是越来越明显,联邦政府没有达到的任务。美国。疾病控制和预防中心(CDC)中心已经有了一个测试积压,再加上许多测试套件它发送给国家正在证明有缺陷的。 “严峻的实现对我来说是不存在的骑兵来了,” derisi说。 “疾病预防控制中心不打算在坐和加州提供的测试数以万计。无论是当地卫生部门 - 他们没有动力去做。”

严峻的实现对我来说是不存在的骑兵来了“。

乔derisi博士

 

Joe Derisi wearing a black face mask, white lab coat, and blue gloves in the lab; lab team members work behind him.

PK10注册网站生物化学乔derisi,博士,帮助确定在陈女士扎克伯格biohub 2003现在联席总裁原来的SARS病毒,他带领负责研究中心的一部分转化为covid测试。

由二月下旬,海湾地区已经开始准备迎接它自己的covid案件激增。 derisi与陈慧娴的每天发短信,MD '12,酝酿解决真正的问题。陈在PK10注册网站她的学生日子遇到了derisi,并已通过他的诀窍铲除神秘感染的原因,留下了深刻印象 - 包括2003年的非典疫情和鞭打追杀大蟒蛇,玄凤鹦鹉,和蜜蜂。所以,在2016年,当陈和她的丈夫,Facebook的创始人马克·扎克伯格,做出了 6亿$的礼品创建biohub与根除传染病的目标,他们要求derisi领导它。现在他们想知道他们如何帮助阻止新兴covid流行。

derisi组装小型工作组,以集思广益。那么,出了蓝色,他的手机响了起来。 “我几乎没有回答,因为我认为这是一个推销员,”他回忆道。它实际上是纽森,加州州长。他想知道derisi认为国家应该做些什么来避免其covid响应错误。更多的测试,derisi说,没有丢失一个节拍。如果你想约的人隔离或封锁住了经济的部分明智的决定,他告诉纽瑟姆,你需要知道病毒是和谁的感染。换句话说,你需要能够测试的人很多。 “否则你盲目飞行,”他告诉州长。

交谈了derisi思考。谁是要做到这一切的测试?这是越来越明显,联邦政府没有达到的任务。美国。疾病控制和预防中心(CDC)中心已经有了一个测试积压,再加上许多测试套件它发送给国家正在证明有缺陷的。 “严峻的实现对我来说是不存在的骑兵来了,” derisi说。 “疾病预防控制中心不打算在坐和加州提供的测试数以万计。无论是当地卫生部门 - 他们没有动力去做。”

严峻的实现对我来说是不存在的骑兵来了“。

乔derisi博士


2/23:
案件激增意大利,最终关停世界上主要的鼻拭子厂

2/29:
美国。 FDA宣布一项新政策,使临床实验室开发他们自己的测试

2/29:
PK10注册网站实验室的科学家开始致力于在内部测试


但有关biohub什么?他们有空间来建立一个实验室,科学家和工程师开始下载,一行志愿者愿意做的工作,甚至供体提供为它付出。 “什么可能我们做这将是更重要?” derisi问自己。 “没有。”

有这样一个问题。该biohub没有一个许可证来运行一个临床实验室。作为一个研究中心研究人类疾病的生物,在biohub使用类似的诊断实验室的工具和技术。但在研究实验室旨在促进创新和实验,临床实验室优先考虑的一致性和监管。质量必须严格控制,文件系统建立,测试验证。该biohub的研究团队的一部分转化为临床人们不会是微不足道的。

“我们试图想他们可以做些什么框外,”说 史蒂夫·米勒博士PK10注册网站的临床微生物实验室,这往往与研究项目biohub伙伴的主任。当covid命中,米勒和他的工作人员已经开始日以继夜地工作,以制定可行的诊断测试,并收集必要的设备和用品,准备的患者有望开始涌向PK10注册网站医院成群。他的团队有办法做到每天也许几百测试 - 可能不足以满足PK10注册网站的需求,更不用说湾区。

在biohub团队计算,他们可以轻松实现每一天率在千,他们告诉米勒,显著提高加州的检测能力 - 这,在没有国家领导的,是(现在仍然是)由商业拼凑系统填充和公共实验室。但球队是由国家的临床许可法规掣肘。那么该怎么办?也许他们可以考验人作为调查研究的一部分吗?没有,因为那时的研究参与者在法律上不能得到他们的结果。也许他们可以发出积极样品,PK10注册网站的验证?不,这将是一个后勤恶梦。好,那么,如果biohub只是获得了认证什么作为临床实验室吗?

“我最初的反应是‘哦,见鬼,不,’”说 ED thornborrow博士,米勒的老板和所有UCSF临床实验室的医疗主任。加州的许可规则,他知道,比联邦指导方针更严格。在正常情况下满足这些需要几个月的时间,可能是一年 - 不可接受的时间表。但他同意研究的可能性,并得出结论这两种条件下是可行的。

第一,加州卫生部门必须批准biohub作为PK10注册网站的临床实验室之一的临时延长。检查。

第二,在biohub出身的测试实验室,都必须由临床实验室的科学家,谁完成了研究生课程的几个月,并通过了考试行货专家工作人员。 “这是不会发生的,” thornborrow说。 “这些人都是供不应求。你不能只是去现场租用数十人的;他们不是在那里“。但数百名PK10注册网站的研究生和训练做实验室科学研究员均提供自己的劳动。 “如果我们要得到biohub实验室掉在地上,我们必须先获得加州修改法律,” thornborrow说。

因此,从法律事务办公室UC的帮助下,他们做到了。 3月12日,世界卫生组织后的第二天正式宣布流感大流行,州长纽森发布行政命令坭兴人手限制。检查,检查。

突然,路上核证biohub的covid测试实验室是显而易见的。现在derisi和他的团队刚刚建立它。

但有关biohub什么?他们有空间来建立一个实验室,科学家和工程师开始下载,一行志愿者愿意做的工作,甚至供体提供为它付出。 “什么可能我们做这将是更重要?” derisi问自己。 “没有。”

有这样一个问题。该biohub没有一个许可证来运行一个临床实验室。作为一个研究中心研究人类疾病的生物,在biohub使用类似的诊断实验室的工具和技术。但在研究实验室旨在促进创新和实验,临床实验室优先考虑的一致性和监管。质量必须严格控制,文件系统建立,测试验证。该biohub的研究团队的一部分转化为临床人们不会是微不足道的。

“我们试图想他们可以做些什么框外,”说 史蒂夫·米勒博士PK10注册网站的临床微生物实验室,这往往与研究项目biohub伙伴的主任。当covid命中,米勒和他的工作人员已经开始日以继夜地工作,以制定可行的诊断测试,并收集必要的设备和用品,准备的患者有望开始涌向PK10注册网站医院成群。他的团队有办法做到每天也许几百测试 - 可能不足以满足PK10注册网站的需求,更不用说湾区。

在biohub团队计算,他们可以轻松实现每一天率在千,他们告诉米勒,显著提高加州的检测能力 - 这,在没有国家领导的,是(现在仍然是)由商业拼凑系统填充和公共实验室。但球队是由国家的临床许可法规掣肘。那么该怎么办?也许他们可以考验人作为调查研究的一部分吗?没有,因为那时的研究参与者在法律上不能得到他们的结果。也许他们可以发出积极样品,PK10注册网站的验证?不,这将是一个后勤恶梦。好,那么,如果biohub只是获得了认证什么作为临床实验室吗?

“我最初的反应是‘哦,见鬼,不,’”说 ED thornborrow博士,米勒的老板和所有UCSF临床实验室的医疗主任。加州的许可规则,他知道,比联邦指导方针更严格。在正常情况下满足这些需要几个月的时间,可能是一年 - 不可接受的时间表。但他同意研究的可能性,并得出结论这两种条件下是可行的。

第一,加州卫生部门必须批准biohub作为PK10注册网站的临床实验室之一的临时延长。检查。

第二,在biohub出身的测试实验室,都必须由临床实验室的科学家,谁完成了研究生课程的几个月,并通过了考试行货专家工作人员。 “这是不会发生的,” thornborrow说。 “这些人都是供不应求。你不能只是去现场租用数十人的;他们不是在那里“。但数百名PK10注册网站的研究生和训练做实验室科学研究员均提供自己的劳动。 “如果我们要得到biohub实验室掉在地上,我们必须先获得加州修改法律,” thornborrow说。

因此,从法律事务办公室UC的帮助下,他们做到了。 3月12日,世界卫生组织后的第二天正式宣布流感大流行,州长纽森发布行政命令坭兴人手限制。检查,检查。

突然,路上核证biohub的covid测试实验室是显而易见的。现在derisi和他的团队刚刚建立它。


3/2:
在biohub创建covid-19特遣部队

3/4:
加利福尼亚州宣布进入紧急状态

3/9:
PK10注册网站开始提供内部测试,但只有足够的能力来测试自己的病人

3/11:
谁宣布流感大流行

3/12:
安东尼福西,过敏和传染病国家研究所所长,呼吁美国的测试响应“一个失败”

3/12:
加州州长纽森缓解了临床测试实验室的认证要求,给biohub队绿灯开始构建PK10注册网站的临床实验室的延伸


Photo of COVID-19 vial samples in an organized box in the BioHub lab.

该covid在biohub测试实验室,PK10注册网站的临床实验室的延伸,具有处理超过2500个,每天病人样本的能力。PK10注册网站报价感谢公共卫生部门免费检测到所有的加州水郡从陈扎克伯格主动额外的容量和支持。

A female lab assistant works with the samples in the lab.

伊丽莎白·麦卡锡,一个MD /博士研究生在PK10注册网站,处理病人样本。当流行病袭来,200名多名学生和研究员志愿工作的测试实验室。

只要derisi听说纽森的订单,他转述消息告诉了专案组。其成员在会议室挤了,还在规划研究项目。 “乔进来说,“OK,这种情况正在发生。我们要转变过来做测试,”回忆说:”艾米莉·克劳福德博士'12,其中derisi和其他biohub黄铜任命为特遣部队的领先优势。 “我很震惊,”她说。 “我记得晚打电话给我妈妈在晚上是一样,‘这完全是疯了。’”然后,她想, 来吧.

“我做的第一件事是了解我不能掌管一切,因为它是铺天盖地,没有人能做到这一点,”克劳福德说。她问VIDA ahyong,博士'15,在谁曾率先在柬埔寨idseq项目,是她共同牵头的biohub研究科学家。同时,他们招募了数十名志愿者,组织他们到子团队。一个小组将源供应,另一个将监督设备,另一个将处理病人样本,另一个将设计数据系统,另一个会处理实验室废弃物,等等。共有13支球队所有。大家都有过在对;这样一来,如果有人感染了病毒,他们的合作伙伴可以接管。

Vida Ahyong, Joe DeRisi, and Emily Crawford in face masks, lab coats, and gloves.

乔derisi用VIDA ahyong博士(左)和Emily克劳福德博士,研究科学家在biohub谁共同领导的检测实验室建设姿势。

球队跳进行动。 “这是一个疯狂的推动,” derisi回忆说。 “从字面上实验室是在3月12日空,并在3月13日,我们开始从实验室下来UCSF街上设备卡丁车。那天下雨,还有我们,牵引$ 80,000机器人沿着16街自行车道。”

由3月16日,大部分作品都是到位。米勒和thornborrow的指导下,团队发现了一个协议,用于处理病人样本。他们买了,借来的,或者自己建造的机器用于处理样品 - 并已经将它们命名为蝙蝠侠,木香,高粱,尼科,猫,碧昂斯,J-Lo和夏奇拉。手套,口罩,瓶,盘,和化学试剂:他们已经运行的机器储备物资。他们估计他们将需要一两周,以确保一切工作顺利,并得到了文书工作过的美国食品和药物管理局(FDA)认证。然后PK10注册网站的校长叫。

由于大流行开始, SAM hawgood,内外全科医学士,一直保持与derisi和biohub团队保持密切联系,对他们欢呼,并帮助删除政治上的障碍。但作为covid在中国以外的情况下膨胀 - 首先在意大利;那么在伊朗,韩国和日本 - hawgood担心波会打旧金山前的测试实验室准备好了。 “很明显,我们的户主陷入麻烦,”他回忆道。 “我有紧急的强烈感觉,我们需要做的一切,我们无法得到不堪重负;天要紧,甚至几个小时。” hawgood,PK10注册网站的亚瑟和托尼·雷贝岩教授以及它的校长,敦促derisi加快时间表。

这样我们就拖着$ 80,000机器人沿着16街自行车道“。

乔derisi博士

“在这一点上,我们都认为我们仍然有在离开一个星期,” ahyong召回。 “那是,‘只是开玩笑,你有48小时。’”接下来的两天里,她说,“是一个非常大的模糊。这是所有的肾上腺素。每个人都在想,“谁在乎睡了吗?让我们来完成这件事。”

它是在周三午夜临近,3月18日 - 后仅六天内,他们得到了反超开始建立测试设备 - 当他们跑了最后的验证检查,以证明该实验室满足FDA的标准认证。 “我们围坐在我们的手指交叉,” ahyong说。 “当实验结束了,我们看到了报告,我们从字面上高兴得跳了起来。”两天后,他们跑了他们的第一个病人的样本。 “我们这么累。我们很高兴....我们是活“。

喜庆并没有持续太久。由四月,biohub队扩大它们的操作和训练的学生足够的工人每天处理超过2500次的测试。但几乎没有人送了样品。这是忙碌的一天,如果他们有超过250“的几个星期,我们就像,‘好吧,我们已经建立了这个,也没有人来了,’”米勒说。

只要derisi听说纽森的订单,他转述消息告诉了专案组。其成员在会议室挤了,还在规划研究项目。 “乔进来说,“OK,这种情况正在发生。我们要转变过来做测试,”回忆说:”艾米莉·克劳福德博士'12,其中derisi和其他biohub黄铜任命为特遣部队的领先优势。 “我很震惊,”她说。 “我记得晚打电话给我妈妈在晚上是一样,‘这完全是疯了。’”然后,她想, 来吧.

“我做的第一件事是了解我不能掌管一切,因为它是铺天盖地,没有人能做到这一点,”克劳福德说。她问VIDA ahyong,博士'15,在谁曾率先在柬埔寨idseq项目,是她共同牵头的biohub研究科学家。同时,他们招募了数十名志愿者,组织他们到子团队。一个小组将源供应,另一个将监督设备,另一个将处理病人样本,另一个将设计数据系统,另一个会处理实验室废弃物,等等。共有13支球队所有。大家都有过在对;这样一来,如果有人感染了病毒,他们的合作伙伴可以接管。

Vida Ahyong, Joe DeRisi, and Emily Crawford in face masks, lab coats, and gloves.

乔derisi用VIDA ahyong博士(左)和Emily克劳福德博士,研究科学家在biohub谁共同领导的检测实验室建设姿势。

球队跳进行动。 “这是一个疯狂的推动,” derisi回忆说。 “从字面上实验室是在3月12日空,并在3月13日,我们开始从实验室下来UCSF街上设备卡丁车。那天下雨,还有我们,牵引$ 80,000机器人沿着16街自行车道。”

由3月16日,大部分作品都是到位。米勒和thornborrow的指导下,团队发现了一个协议,用于处理病人样本。他们买了,借来的,或者自己建造的机器用于处理样品 - 并已经将它们命名为蝙蝠侠,木香,高粱,尼科,猫,碧昂斯,J-Lo和夏奇拉。手套,口罩,瓶,盘,和化学试剂:他们已经运行的机器储备物资。他们估计他们将需要一两周,以确保一切工作顺利,并得到了文书工作过的美国食品和药物管理局(FDA)认证。然后PK10注册网站的校长叫。

由于大流行开始, SAM hawgood,内外全科医学士,一直保持与derisi和biohub团队保持密切联系,对他们欢呼,并帮助删除政治上的障碍。但作为covid在中国以外的情况下膨胀 - 首先在意大利;那么在伊朗,韩国和日本 - hawgood担心波会打旧金山前的测试实验室准备好了。 “很明显,我们的户主陷入麻烦,”他回忆道。 “我有紧急的强烈感觉,我们需要做的一切,我们无法得到不堪重负;天要紧,甚至几个小时。” hawgood,PK10注册网站的亚瑟和托尼·雷贝岩教授以及它的校长,敦促derisi加快时间表。

这样我们就拖着$ 80,000机器人沿着16街自行车道“。

乔derisi博士

“在这一点上,我们都认为我们仍然有在离开一个星期,” ahyong召回。 “那是,‘只是开玩笑,你有48小时。’”接下来的两天里,她说,“是一个非常大的模糊。这是所有的肾上腺素。每个人都在想,“谁在乎睡了吗?让我们来完成这件事。”

它是在周三午夜临近,3月18日 - 后仅六天内,他们得到了反超开始建立测试设备 - 当他们跑了最后的验证检查,以证明该实验室满足FDA的标准认证。 “我们围坐在我们的手指交叉,” ahyong说。 “当实验结束了,我们看到了报告,我们从字面上高兴得跳了起来。”两天后,他们跑了他们的第一个病人的样本。 “我们这么累。我们很高兴....我们是活“。

喜庆并没有持续太久。由四月,biohub队扩大它们的操作和训练的学生足够的工人每天处理超过2500次的测试。但几乎没有人送了样品。这是忙碌的一天,如果他们有超过250“的几个星期,我们就像,‘好吧,我们已经建立了这个,也没有人来了,’”米勒说。


3/13:
总统王牌宣布全国进入紧急状态

3/16:
海湾地区县发出第一个收容所就地订单在美国

3/18:
该biohub的测试试验通行证FDA认证的最终验证检查

3/20:
所述biohub实验室处理其第一患者样品


Lab works talk around a table in the lab.

伊丽莎白·麦卡锡(中心)标签与其他UCSF学生来样艾里翁(左)和瓦伦蒂娜·加西亚。

Two lab assistants work with samples.

瓦伦蒂娜加西亚(右)检查与保早川塞帕,在PK10注册网站实验室技术员患者样品管中。

一个原因是,住院大家的激增此前预期没有击中旧金山,一个事实,即专家归因于城市的早期庇护就地订单。但他们知道该病毒仍在传播。数十万当地居民的等着知道自己是否能安全地回到学校或工作。那么,为什么没有他们得到测试?

答案,原来,是拭子。测试某人covid-19,你需要一个棉签 - 基本上,一个长期的,无菌棉签 - 品尝他们的鼻道内的病毒的存在。但拭子,在biohub队了解到,供不应求。 “我们谈论的是一个全球性的流感大流行,” thornborrow说。 “世界上每一个国家正在对鼻拭子狂奔。”更糟的是,在意大利爆发已关闭了世界上主要的棉签厂。

“这是令人费解,”说 madhura拉加博士,一个PK10注册网站的博士后研究员谁帮助在biohub建立测试实验室。 “我们有所有这些昂贵的设备,我们有所有这些人手,但我们被这个小小的棉签的限制。”

因此,PK10注册网站和biohub团队去寻找更多的拭子。校长hawgood了与贝尼奥夫,长期担任PK10注册网站捐赠者是谁,作为云计算CEO公司销售团队,在中国有广泛的业务联系联系。 “销售人员对在中国的地面会从厂到产品出厂,靴子” thornborrow说。 “他们会把我包装说明书的图片或广告的拭子和问我,‘将这项工作?’”最终,他们发现了一些有信誉的供应商,并下令成千上万拭子被分配到医院,县卫生部门,不管是谁需要他们。

同时,PK10注册网站和 陈扎克伯格倡议(CZI),这对夫妻的慈善企业,宣布 - 感谢biohub扩张 - PK10注册网站将提供免费检测 所有58县卫生部门在加利福尼亚州。在商业实验室担心设备短缺或积压,许多卫生部门已发出严格测试指南,并举行社区测试回来。PK10注册网站和CZI的消息公布后,但是,越来越多的患者样本也开始出现在biohub起来 - 而不是仅仅从医院,但也从养老院,收容所,监狱,监狱,和研究团队调查不足和特别是弱势群体。 [看到 “不平等的流行病”.]由5月初,该实验室是在接近满负荷运行。

“他们是真正的交易,”说 保罗·贝亚德,MD '90,英里的首席医疗官的LaCLÍNICA,在阿拉米达社区诊所,康特拉科斯塔和索拉诺县的网络。贝亚德开始变得厌倦了从商业实验室等待长达两周的测试结果后,送样到biohub。 “每天都有病人没有得到的结果乘以使病毒传播的机会,”他说。但随着biohub内一到两天转身质量测试,拉CLÍNICA是驾车通过测试能够提供和做接触者追踪,这样家庭成员,室友和同事会知道他们是否应该得到测试了。而且由于测试是免费的,谁是保险或无证人没有到他们是否能买得起他们的担心。

消除这种障碍测试已经成为骄傲的biohub队一分。 “我们已经成功地不仅在PK10注册网站领先体积的同时也有利于扩大测试对整个国家,” thornborrow说。 “我不认为那会是可能没有这么多的人的工作和支持。它肯定是其中的一个“它需要一个村庄来测试村”的那种东西。”

一个原因是,住院大家的激增此前预期没有击中旧金山,一个事实,即专家归因于城市的早期庇护就地订单。但他们知道该病毒仍在传播。数十万当地居民的等着知道自己是否能安全地回到学校或工作。那么,为什么没有他们得到测试?

答案,原来,是拭子。测试某人covid-19,你需要一个棉签 - 基本上,一个长期的,无菌棉签 - 品尝他们的鼻道内的病毒的存在。但拭子,在biohub队了解到,供不应求。 “我们谈论的是一个全球性的流感大流行,” thornborrow说。 “世界上每一个国家正在对鼻拭子狂奔。”更糟的是,在意大利爆发已关闭了世界上主要的棉签厂。

“这是令人费解,”说 madhura拉加博士,一个PK10注册网站的博士后研究员谁帮助在biohub建立测试实验室。 “我们有所有这些昂贵的设备,我们有所有这些人手,但我们被这个小小的棉签的限制。”

因此,PK10注册网站和biohub团队去寻找更多的拭子。校长hawgood了与贝尼奥夫,长期担任PK10注册网站捐赠者是谁,作为云计算CEO公司销售团队,在中国有广泛的业务联系联系。 “销售人员对在中国的地面会从厂到产品出厂,靴子” thornborrow说。 “他们会把我包装说明书的图片或广告的拭子和问我,‘将这项工作?’”最终,他们发现了一些有信誉的供应商,并下令成千上万拭子被分配到医院,县卫生部门,不管是谁需要他们。

同时,PK10注册网站和 陈扎克伯格倡议(CZI),这对夫妻的慈善企业,宣布 - 感谢biohub扩张 - PK10注册网站将提供免费检测 所有58县卫生部门在加利福尼亚州。在商业实验室担心设备短缺或积压,许多卫生部门已发出严格测试指南,并举行社区测试回来。PK10注册网站和CZI的消息公布后,但是,越来越多的患者样本也开始出现在biohub起来 - 而不是仅仅从医院,但也从养老院,收容所,监狱,监狱,和研究团队调查不足和特别是弱势群体。 [看到 “不平等的流行病”.]由5月初,该实验室是在接近满负荷运行。

“他们是真正的交易,”说 保罗·贝亚德,MD '90,英里的首席医疗官的LaCLÍNICA,在阿拉米达社区诊所,康特拉科斯塔和索拉诺县的网络。贝亚德开始变得厌倦了从商业实验室等待长达两周的测试结果后,送样到biohub。 “每天都有病人没有得到的结果乘以使病毒传播的机会,”他说。但随着biohub内一到两天转身质量测试,拉CLÍNICA是驾车通过测试能够提供和做接触者追踪,这样家庭成员,室友和同事会知道他们是否应该得到测试了。而且由于测试是免费的,谁是保险或无证人没有到他们是否能买得起他们的担心。

消除这种障碍测试已经成为骄傲的biohub队一分。 “我们已经成功地不仅在PK10注册网站领先体积的同时也有利于扩大测试对整个国家,” thornborrow说。 “我不认为那会是可能没有这么多的人的工作和支持。它肯定是其中的一个“它需要一个村庄来测试村”的那种东西。”


3/22:
PK10注册网站等各大海湾地区医疗中心呼吁口罩,隔离衣,和鼻拭子的捐赠,在运动中的社区和私营部门的帮助流露设置来解决设备短缺

3/26:
美国。引领世界covid-19的情况下,有超过80,000

4/2:
在biohub实验室扩展了它的测试能力为每天2688个测试

4/2:
流感大流行已经患者超过100万人在171个国家

4/16:
PK10注册网站提供免费从陈扎克伯格主动检测到所有的加州水郡公共卫生部门,感谢biohub实验室和支持

4/24:
加州平均每天16000个测试;州长纽森说,国家将需要每天至少60000次测试,以重开

4/26:
全球死亡人数超过20万


Joe Derisi wearing a black face mask talks with Emily Crawford and Vida Ahyong in the lab.

乔derisi聊天时与VIDA ahyong和Emily克劳福德在biohub测试实验室。他们的团队买,借,或自己建造机加工样品和储存设备和用品。

A lab assistant in a blue mask and gloves puts samples into a machine.

亚历山大梅里曼,一个UCSF MD /博士生,准备被装载到加工机的样品管。

这些天,biohub的covid测试实验室发出嗡嗡声从早晨到晚上。样本条形码,记录,和用于处理制备。机器装载有测试管材和板材。试剂加入。数据检查和结果报告。

与该biohub球队带来了这家企业通过速度和创造力是极不平凡,它的成功一直担任其他美国模型研究机构建立自己的诊断实验室。 “我们展示了加州大学伯克利分校如何做到这一点;我们发现加州大学圣克鲁斯分校如何做到这一点;我们建议很多,很多人在全国各地,” derisi说。在一起,这些学术出身的服务实验室同时铺就了一条前进的道路,当国内检测能力不足已经阻碍了悲剧性的早期应对流感大流行。 “我们所了解到的是,大学和研究中心,如biohub具有令人难以置信的,尚未开发的潜力以应对紧急情况方面,我不认为这个国家已经见过的,” derisi说。

在此期间,该流行病继续蔓延,甚至紧张的额外的测试能力的美国已经成功地建立起零碎。没有一个国家战略,地方政府和医疗服务提供者继续做出隔离测试,与对方进行人员和物资的竞争决定。许多在大流行开始困扰着这个支离破碎的系统相同的瓶颈也开始重新崛起,包括流动的供应链,在商业实验室积压,并排长测试中心。

最终,当covid风暴办结的粉尘,biohub团队将恢复到原来的任务,其中包括狩猎下来在加利福尼亚州,柬埔寨病原体和近及远在地球的其他角落。学生志愿者们将继续他们的论文项目,借用机器人将走回到了第16街,临床实验室将关门。就目前而言,虽然,团队将继续,只要是需要他们的服务搅动了测试 - 其中,从事物的样子,可能是一个很长的时间。

这些天,biohub的covid测试实验室发出嗡嗡声从早晨到晚上。样本条形码,记录,和用于处理制备。机器装载有测试管材和板材。试剂加入。数据检查和结果报告。

与该biohub球队带来了这家企业通过速度和创造力是极不平凡,它的成功一直担任其他美国模型研究机构建立自己的诊断实验室。 “我们展示了加州大学伯克利分校如何做到这一点;我们发现加州大学圣克鲁斯分校如何做到这一点;我们建议很多,很多人在全国各地,” derisi说。在一起,这些学术出身的服务实验室同时铺就了一条前进的道路,当国内检测能力不足已经阻碍了悲剧性的早期应对流感大流行。 “我们所了解到的是,大学和研究中心,如biohub具有令人难以置信的,尚未开发的潜力以应对紧急情况方面,我不认为这个国家已经见过的,” derisi说。

在此期间,该流行病继续蔓延,甚至紧张的额外的测试能力的美国已经成功地建立起零碎。没有一个国家战略,地方政府和医疗服务提供者继续做出隔离测试,与对方进行人员和物资的竞争决定。许多在大流行开始困扰着这个支离破碎的系统相同的瓶颈也开始重新崛起,包括流动的供应链,在商业实验室积压,并排长测试中心。

最终,当covid风暴办结的粉尘,biohub团队将恢复到原来的任务,其中包括狩猎下来在加利福尼亚州,柬埔寨病原体和近及远在地球的其他角落。学生志愿者们将继续他们的论文项目,借用机器人将走回到了第16街,临床实验室将关门。就目前而言,虽然,团队将继续,只要是需要他们的服务搅动了测试 - 其中,从事物的样子,可能是一个很长的时间。


5/12:
加州扩展了它的测试能力,每天有35,000台测试

5/27:
我们。死亡人数超过10万辆,远远超过其他任何国家高

6/4:
全世界已知病例数量的增长比以往更快,以每天超过10万个新发感染

6/28:
covid-19已经生病有10万人丧生和超过50万

7/7:
美国。命中3万总例;加利福尼亚打破了与超过9000个新病例日志

7/21:
今天,这种流行病继续加快;测试瓶颈仍然困扰许多美国的


Cover of UCSF杂志: 夏季2020. Illustration of health care worker in PPE covering head and face, with only the eyes seen through goggles; a coronavirus symbol is in the middle of the head covering; a labyrinth surrounds the person with coronavirus symbols.

UCSF杂志

特刊:打击冠状病毒

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